A TFRA é depositária da Coleção Teixeira de Freitas, uma coleção de arte contemporânea que está focada principalmente nas duas últimas décadas e em artistas emergentes. A coleção conta também com um grupo de artistas e obras históricas dos anos 60 e 70 que servem como matriz histórica para os variados temas e conceitos da coleção. O principal foco da coleção são trabalhos que desenvolvem temas relacionados com arquitetura. Ainda assim, outros temas são também trabalhados na coleção, como literatura, escrita, pintura contemporânea e desenho.
Em conjunto com esta coleção, a TFRA é também depositária de uma coleção de livros de artista, edições especiais e efémeras que conta com mais de 1000 obras.
Desde 2017 a TFRA apoia o programa anual da Taffimai, uma editora de livros de artista, múltiplos, e edições especiais, que tem como foco principal apoiar produções artísticas e desenvolver projetos independentes. A Janela Taffimai nasce paralelamente ao projeto editorial, consistindo num espaço de cariz experimental onde uma janela é usada como um espaço para intervenção artística. A Janela Taffimai está localizada no coração do bairro da Madragoa, em Lisboa, na janela da Limbo, uma loja de plantas e cerâmicas. O programa conta com 6 a 8 comissões de artistas por ano.